Claude 如何加速蛋白质设计与分析化学
来自 Anthropic Research · 期号 2026-08-18
摘要
Anthropic 测试了 Claude 在两项生命科学任务上的表现。 蛋白质设计方面，Claude（Mythos Preview 和 Opus 4.8）针对 15 个靶点从头设计蛋白质结合剂，成功 14 个。其设计的结合成功率在 22% 到 35% 之间，而行业典型水平是 10% 到 15%。部分设计的结合强度比此前最好的已发表结果高出数倍。 分析化学方面，Claude Opus 5 处理了一家合同实验室的核磁共振和液相色谱-质谱原始数据，仅凭两句话的提示，分别在 23 分钟和 19 分钟内给出结果，氢原子计数和纯度（96.4% 对 96.33%）均与实验室分析一致。 这些实验展示了通用模型如何加速药物研发早期阶段中耗时且依赖专业经验的任务。
深读
导读 Anthropic 发布了 Claude 在生命科学领域的两项实验结果。在蛋白质设计任务中，Claude 针对 15 个靶点从头设计蛋白质结合剂，成功 14 个，其结合成功率（22%–35%）显著高于行业典型水平（10%–15%）。在分析化学任务中，Claude Opus 5 仅凭原始仪器文件和两句话的提示，在 23 和 19 分钟内完成了核磁共振和液相色谱-质谱数据的处理与分析，结果与专业实验室一致。这些实验展示了通用 AI 模型在加速药物研发早期阶段中耗时且依赖专业经验的任务上的潜力。 关键信息 - 蛋白质设计：Claude（Mythos Preview 和 Opus 4.8）针对 15 个靶点从头设计蛋白质结合剂，湿实验验证成功 14 个靶点。 - 结合成功率：多靶点模式下，Mythos Preview 和 Opus 4.8 的整体命中率分别为 26.7% 和 22.6%；单靶点模式下，Mythos Preview 的命中率提升至 35.1%。行业典型水平为 10%–15%。 - 结合强度：部分设计的结合强度比此前最好的已发表结果高出数倍。针对 RBX1 靶点，Claude 的命中率为 40%，而 Adaptyv Bio 竞赛参与者的平均命中率仅为 3.7%。 - 分析化学：Claude Opus 5 处理合同实验室的核磁共振和液相色谱-质谱原始数据，氢原子计数与实验室分析相差不到 0.08，纯度测量结果为 96.4%（实验室为 96.33%）。 - 处理时间：Claude 在 23 分钟内完成核磁共振数据处理，19 分钟内完成液相色谱-质谱数据处理，而实验室的最终报告在首次采集光谱后四天送达。 - 模型与资源：实验使用了 Mythos Preview 和 Opus 4.8/5。蛋白质设计任务中，多靶点模式消耗了最多 12,500 个 NVIDIA H100 小时的计算资源。 逐节讲解 蛋白质设计：从头设计结合剂 Claude 被要求针对 15 个常用蛋白质靶点（包括 Adaptyv Bio 的 BenchBB 基准集和两个新靶点 15-PGDH、GDF-8）设计微型结合剂（minibinder）。微型结合剂是一种小蛋白质，能紧密附着在靶点蛋白上，是现代药物中许多疗法的作用基础。传统上，为每个靶点从头设计结合剂需要蛋白质工程师花费数周至数月。 实验采用两种模式：多靶点模式（Claude 在 48 小时内同时设计所有靶点）和单靶点模式（每个靶点单独进行 24 小时会话）。Claude 被赋予了详细的提示、互联网访问权限、蛋白质设计相关论文资源、GPU 访问权限（用于运行开源蛋白质设计和折叠模型），以及 Google Drive、Slack、Gmail 和 BioRxiv 的连接器。启动后，研究人员未提供任何额外的科学或操作指导，Claude 自主完…